同級生の美波や転校生のアルマ、対策課の面々と繰り広げられる青春学園ドラマ――それはアキラの意識が作りだした仮想空間。アキラの記憶を呼び戻そうと、仮想空間に潜ってアキラの潜在意識に迫る対策課一同、そして密かに介入する『ユグ』。
そこでアキラは、かつて東京を崩壊させたエクスアームナンバーイレブンを装着した自分そっくりの『ベータ』と対峙する。アキラは、ベータこそが、全ての災いの根元であるのを強く感じる。
Akira conjures up a virtual space where Minami is a classmate, Alma a transfer student, and the rest of the Squad is also involved in a high school setting. The Squad attempts to revive Akira's memories by stimulating his subconscience, and are secretly joined by Ygg. Akira ends up facing off against "Beta," an individual identical to himself possessing EX-ARM Number 11, which caused great destruction in Tokyo. He comes to believe that Beta is the root cause of everything.
Akira é colocado em um experimento para tentar relembrar de memórias que encobrem detalhes de acontecimentos que talvez revelem algo sobre o Ataque de Tóquio.
Diesmal beschäftigt sich die Anti-Ex-Arm-Abteilung mit einem internen Fall: Akira. Um seine Erinnerungen wieder zutage zu fördern, begeben sie sich in eine auf seinem Bewusstsein aufbauende VR-Umgebung. Doch bald schon stellt sie diese vor größere Probleme als erwartet.
Pour tenter de raviver les souvenirs d'Akira, la section anti-EX-ARM le plonge dans un monde de réalité virtuelle basé sur sa vie avant son accident. Toute l'équipe rejoint Akira dans ce monde factice pour tenter de trouver un déclencheur qui lui fera recouvrer la mémoire.
