細菌雲が空に重く立ちこめる近未来。ニューポート分署タンクポリス課の婦警レオナは相棒のアルと豆戦車ボナパルトを駆り、悪人退治に励んでいた。そんなある夜、現場に急行中の二人は謎のクモ型機動兵器と遭遇する。
レオナの白バイ隊時代の同僚・シャロンが殺害された。レオナは署長に休職届けを叩き付け、単独捜査を開始する。アルは彼女に多国籍企業・大日本技研と事件の関連を教えるが、そこにはドス黒い罠が待ち受けていた…！
放射性物質を満載したトレーラーが、何者かに乗っ取られた！ このまま市内で爆発すれば、ニューポートの街は廃墟と化してしまう…。AIに制御され、防弾装備を施されたトレーラーを止められるのはタンクポリスのみだ！
ボナパルトが盗まれた〜！ 犯人は双子のアンドロイド・アンナプーマとユニプーマ。レオナとアルは愛車を追って細菌雲立ちこめる中へ飛び出して行く。影に見え隠れする違法バーチャルドラッグ密売…その黒幕の正体は？
ニューポートシティでは武装テロ事件が頻発していた。駆けつけるタンクポリス課隊員をあざ笑うかのように、痕跡も残さず、事件現場から忽然と姿を消す犯人たち。そしてついにテロの魔手は、ウェザビー市長の身に…！
重傷を負わされた市長は、警察病院へ搬送された。警護するブレンテンたちの前に、三たび現れる機動兵器。一方、レオナは全ての事件を結びつける人物の正体をつかみかけていた。果たして最後に勝つのは正義か、悪か？
