Anni og Rudi Jensen har været kærester siden ungdommen og lykkeligt gift i 20 år. Datteren er sød og dygtig i skolen, økonomien er fornuftig, og familien virker på alle måder harmonisk. Men en dag gør Rudi en dramatisk ende på idyllen. Han dræber sin kone og datter, mens de ligger i deres senge, hvorefter han tager sit eget liv. Med hjælp fra den erfarne psykolog Hanne Hostrup forsøger "Den Sorte Box" at finde årsagen til Rudis tilsyneladende meningsløse gerning. Gennem familien Jensens egne videooptagelser samt interview med familie, venner, kolleger og naboer analyserer programmet begivenhederne og Rudi Jensens adfærd i de seneste 20 år. Hvad var det, der gemte sig i et sort hul et sted inde i Rudi Jensens ellers lyse sind?