Hei was attacked by a group of MIAC agents led by Michiru, the wife of a local restaurant owner who left him three years ago after being a Contractor for the MIAC. Suou and July were able to escape capture from the agents under Hei's instructions. Misaki is tasked by the MIAC to lead a Section 3 unit in delivering a device with the codename as Izanami under orders from Kobayashi. Hei recruits Suou to assist him in launching a raid on the Section 3 convoy under orders from his employers to seize Izanami with the mission seemingly a success after the truck drives away in the attack. Michiru appears to her family in Sapporo, startling her ex-husband and son. Suou watches the waters of Sapporo after the mission, seeing an unknown submarine covertly entering Japanese territorial waters.
霧原未咲は、不思議な双子といるマダムに『三鷹文書』の存在を聞かされた。そのキーワードは「イザナミ」———。そして未咲は、三号機関から暗号名「イザナミ」の指令を受ける。スオウは、諜報機関に隠れ家がバレてしまい、水を自由に操る契約者ミチルに襲われる。しかし、ミチルはノリオが子供の頃からずっと待ち続けていた人…。そんな時、スオウに初めての依頼がきた。それは港から輸送されるある物質を破壊せよというもの。
키리하라 미사키는, 이상한 쌍둥이와 있는 마담에게 "미타카 문서"의 존재를 들었다. 그 키워드는 "이자나미". 그리고 미사키는 삼호 기관에서 암호 이름"이자나미"의 지령을 받는다. 스오우는, 첩보 기관에 은신처가 걸려 버려, 물을 자유롭게 조종하는 계약자 미치루에게 습격당한다. 하지만, 미치루는 노리오가 어렸을 적부터 계속 기다리고 있던 사람... 그 때 스오우에게 첫 의뢰가 왔다. 이는 항구에서 수송되는 어떤 물질을 파괴하라는 것.
Madame Oreille le cuenta a Kirihara que contra a BK-201 han usado una arma anti-contratista, desarrollada a partir del acelerador de partícula que casi destruye la Puerta del Infierno. También le dice que lo que busca se encuentra en el documento Mitaka y que la palabra clave es Izanami. Hei recibe ordenes de darle la primera misión a Suou. Estando en el hotel, por el uso del poder de Suou para matar una cucaracha, son descubiertos por la sección 3. Huyen sin más. Mientras, a Kirihara le ordenan transportar a Izanami. Hei le cuenta a Suou su primera misión. Al día siguiente, Hei detona una bomba en el camino donde está la caravana de camiones que transporta a Izanami, logra llegar al camión donde se supone que está, pero este arranca.
雾原未咲被人告知“三鹰文件”的存在，关键词是“伊邪那美”。而正好未咲也收到了上头的代码指令“伊邪那美”。另一方面，苏芳的藏身处被谍报机关发现，黑被操纵着水的契约者袭击。之后，苏芳收到了黑的第一个任务委托。委托内容是破坏港口货车运输的物质。
