I Virtuali tentano di proteggere Yui da Giganet; il super computer, però, è troppo potente persino per loro e gli otto programmi decidono di sacrificarsi, inserendosi in Giganet per inizializzarlo dall'interno, cosa che era il loro vero compito sin dall'inizio. Dopo un addio struggente, gli otto Virtuali entrano dentro Giganet uno dopo l'altro e Yui, a malincuore, li inizializza assieme al super computer. Ciononostante, Giganet non viene resettato e si ripresenta a Yui con le sembianze di Satoshi. Giganet le spiega che il suo obiettivo di creare un mondo per sé esprime in realtà il proprio desiderio di diventare un essere umano e che è stata proprio Yui, inconsapevolmente, a spingerlo a tanto; è stato lo stesso Giganet a indurre I.R. a contattare Yui anziché Haruna, permettendole di diventare una Virtuale e sottoponendola ad una serie di prove per farla maturare. Yui comprende il desiderio di indipendenza di Giganet, ma gli fa anche capire che non ha bisogno di un corpo umano per essere vivo e di non dover perciò serbare rancore al professor Inukai per come l'ha creato. Giganet ritorna così buono, ma oramai è stato inizializzato e scompare insieme all'intera rete ComNet; grazie alla propria voce e a quella di Haruna, però, Yui recupera i propri poteri di Virtuale e usando il comando di inizializzazione ripristina ComNet e Giganet. Il super computer, riconoscente, ricrea per lei gli otto Virtuali, Jaggy, Virus e Frozen, tornati buoni, e libera Satoshi.
Los virtuales intentan proteger a Yui de Giganet; la supercomputadora, sin embargo, es demasiado poderosa incluso para ellos y los ocho programas deciden sacrificarse, ingresando a Giganet para inicializarlo desde adentro, que era su verdadera tarea desde el principio. Después de una despedida de luchador, los ocho virtuales entran en Giganet uno tras otro y Yui, de mala gana, los inicializa junto con la supercomputadora.
