Charles und Marianne weihen Lelouch und seine Freunde in ihre Pläne ein. Die Raganrök-Verbindung, die sie anstreben, soll eine Welt der Wahrheit und des Friedens schaffen. Diesem großen Ziel opferten sie sogar ihre Kinder Lelouch und Nunnally, die sie einst nach Japan schickten.
Lelouch und Suzaku aber wollen eine Welt des wahren Friedens mit einer Hoffnung für die Zukunft. Sie stellen sich den beiden Unsterblichen in den Weg...
Within the Sword of Akasha, Lelouch learns the truth about his mother's death from the Emperor and Marianne herself. The two reveal their intention to create a gentle world without lies, and begin Ragnarok. Lelouch almost reconciles with them, but changes his mind when he realizes that the world the Emperor desires has no future. Evolving his Geass to its next level, Lelouch defeats the Emperor with the help of the collective unconscious mind of every human, the personification of the "gods" the Emperor sought to defeat, dissolving both him and Marianne into dust. With Ragnarok ended, Lelouch takes up the throne as the new Emperor, using his Geass to make all the dissenters in the court acknowledge him as such. Suzaku is appointed as his new "Knight of Zero," while C.C. looks on from the shadows.
Piégés dans un espace-temps situé entre les deux dimensions, Lelouch interroge Charles au sujet de la mort de sa mère. Celui-ci consent à lui révéler toute la vérité, que le jeune homme a du mal à croire puisque le coupable est mort. Cependant, Charles et Marianne, cachée depuis des années dans le corps d'Anya, ont établi ensemble le plan de la connexion Ragnarök qui doit amener un monde meilleur.
Cependant, Lelouch ne semble pas vouloir accepter l'idyllique vision du futur que le couple impérial a choisi pour le monde...
Lord Waldstein è veramente forte, ed il Geass imposto su Suzaku gli "urla di scappare per sopravvivere". Tuttavia, quando il Knights of One sta per sferrare il colpo di grazia, un’improvvisa esplosione lo fa fermare: Lelouch appare tra le fiamme, iniziando a mettere in atto il suo piano. Tutte le persone su cui aveva imposto il Geass in precedenza iniziano a fare ciò che era stato loro ordinato, ovvero attaccare altri soldati britanni, creando il caos nell’esercito imperiale. Suzaku si rende conto che tutto ciò è opera di Lelouch e decide di cercarlo, correndo via dallo scontro con Waldstein, ma un proiettile colpisce il terreno di fronte a lui ed egli cade nel cratere. Il Knight of One decide di riprendere il controllo della situazione, e sale sul suo Knightmare per fermare lo scontro, quando all'improvviso compare Anya a bordo del Mordred, attaccandolo e affermando di essere convinta che anche lui faccia parte delle truppe ribellatesi; lord Bismark riesce a convincerla che egli sia ancora al fianco dell'imperatore, ed Anya cessa subito di combattere con lui, ma in realtà la ragazza è ancora sotto il controllo di Marianne, e riesce ad ingannare Waldstein riguardo alle sue intenzioni, ovvero al suo desiderio di partecipare all'imminente incontro tra Lelouch e suo padre; Lelouch è infatti giunto faccia a faccia con l'imperatore, e prima che egli possa capire cosa stia per fare, Lelouch si intrappola insieme a lui nel Tempio nel Cielo facendo esplodere la porta d’ingresso, sigillando entrambi in quel luogo. "Adesso, soffri assieme a me per l'eternità!". Nel frattempo C.C. e Anya/Marianne risvegliano Suzaku, rimasto privo di sensi dopo che l'esplosione lo aveva colpito, e lo portano con loro al portale per la Spada di Akasha; dalle parole di Marianne, scopriamo che la spada fa parte del mondo di C., che è a sua volta una sorta di inconscio collettivo, un luogo dove tutte le personalità delle persone, anche quelle morte, si radunano, dando vita ad un'uni
大混乱するエリア11。引き返せない、いや引き返さない。硬く悲壮なまでの決意の元、スザクは戦いに挑む! 最強の部隊を相手に彼は勝利する事が出来るのか!? そしてルルーシュもまた…。人智超越した世界で明かされる驚天動地の事実と真実は!?
Após capturar o pai, Lelouch está agora prestes a descobrir a verdade por detrás da morte da mãe, que subitamente se materializa perante ele.
Estando ya en el Mundo de C, el Emperador Charles y Marianne le cuentan toda la verdad a Lelouch sobre el asesinato de la reina a manos de V.V, la ceguera de Nunnally, el destierro de ambos y la finalidad de la espada de Akasha. No contento con el desinterés absoluto de sus padres, Lelouch, junto con C.C y Suzaku, rechazan los planes del Emperador utilizando al máximo su Geass sobre la conexión Ragnarok, borrando para siempre la existencia del Emperador y Marianne. Más adelante, el mundo entero se sorprende con la llegada del 99° Emperador, Lelouch Vi Britannia.
在C的世界中魯路修了解了九年前的真相以及瑪麗安娜和皇帝的願望,魯路修否定了這願望並強行命令C的世界停下,在此魯路修真正的力量覺醒,皇帝與瑪麗安娜被C的世界吞噬。