Along with Marie's old school friend, Houko Hoshinomiya, Naoto and the others observe the coup d'etat when they get a report that the Japanese government is going to use the Tall Wand against the Yatsukahagi. As the time draws close to the impact of the Tall Wand, Gennai, the mastermind behind the coup d'etat, fires the Yatsukahagi's main cannon. The two geniuses, Marie and Naoto, face a new challenge in order to stop Gennai's rampage.
Marie a su miraculeusement connecter le cerveau d’Halter à un automate militaire, s’assurant ainsi une voie toute tracée à travers les défenses du pilier céleste. Désormais maître des lieux, le groupe cherche les contre-mesures d’urgence à prendre. Il faut faire vite, le redémarrage de Yatsukahagi est proche, et le largage du sceptre de Thor l'est encore plus.
La situación empeora por momentos porque Gennai Hirayama está dispuesto a todo para acabar de una vez con Y. Pese a todo, Marie y Naoto harán lo imposible por revertir la situación.
与玛丽曾经的学友星宫莲子一同注视政变的去向的直人，得知了“神之杖”将于八束胫被日本政府投放。投放时刻紧迫，政变的黑幕，源内发射了八束胫的主炮——！为了阻止源内的暴走，直人和玛丽。两个天才面对挑战…！
Вместе со старой школьной подругой Мари, Хоко Хошиномия, Наото и остальные наблюдают за переворотом, когда получают сообщение о том, что японское правительство собирается использовать Высокий Жезл против Яцукахаги. По мере приближения момента удара Высокого Жезла, Геннай, mastermind переворота, запускает главный пушку Яцукахаги. Два гения, Мари и Наото, сталкиваются с новой задачей, чтобы остановить безумие Генная.
