The Meisterguild sent genius clocksmith Marie Bell Breguet to investigate the anomaly at the Kyoto Core Tower. While there, however, she notices that the army seems to be up to something. Meanwhile, RyuZU arrives at Naoto's school as a transfer student. The entire school is up in arms because the loser Naoto is with a girl as beautiful as RyuZU...
Naoto a perdu son appartement mais a gagné un automate féminin encore bien mystérieux. Tout en allant d’hôtel en hôtel avec elle, Naoto continue sa vie normale entre les cours et le shopping. Il ignore encore que pendant ce temps, Marie et la guilde Meister font tout ce qu’ils peuvent pour sauver la ville de la purge planifiée par l’armée.
La aparición de RyuZU ha supuesto un gran cambio en la vida de Naoto. Por otra parte, Marie está intentando resolver un problema gravísimo para evitar que se haga una purga y mueran 20 millones de personas.