King Koopa and Kooky are going to travel back in time to prevent the Mario Brothers from ever arriving in the Mushroom Kingdom. The Mario Brothers and Toad sneak on board the Doomship to stop them, but the time travel reverts them all into babies.
Ludwig Von a fabriqué une machine à voyager dans le temps pour que les frères Mario disparaissent. Mais même en bébé les Frères Mario et Toad sont quand mêmes malins.
Kooky ha costruito una macchina che trasforma le persone in neonati e riesce ad usarla su Mario e il suo gruppo. Tuttavia, essi riescono a tornare normali e ad impedire il rapimento della principessa Amarena.
El rey Koopa y Kooky viajarán en el tiempo para evitar que los hermanos Mario lleguen al Reino Champiñón. Los hermanos Mario y Toad se escabullen a bordo del Doomship para detenerlos, pero el viaje en el tiempo los convierte a todos en bebés.