Der Auftakt der dritten Season beginnt genau dort, wo die zweite Season endete. Michael schwimmt im Ozean vor Miami, nachdem er aus dem Helikopter des Managements sprang. Mit letzter Kraft kann er zum Strand schwimmen. Dort wartet in Form eines Polizisten sofort Ärger auf Michael. Nachdem er sich kurz in einem Hotel verschanzt hat, befolgt Michael Fionas Rat und stellt sich. Doch im Gefängnis ist Michael nur kurz, denn Harlan - ein Spion, mit dem Michael in seinem früheren Leben einige Missionen durchführte - holt Michael wieder rauß. Harlan konnte ihn finden, da Michael nun nicht mehr vom Management geschützt wird, so können ihn nun alte Feinde auf ihrem Radar finden. Im Haus von Michaels Mum wartet bereits Ärger auf ihn, denn seine Mutter ist sauer, nachdem Sam das halbe Haus in die Luft jagdte (Episode 2.16). Harlan bittet Michael um Hilfe, um den venezuelanischen Verbrecherkönig Rufino Cortez zu stellen und an Venezuela aufzuliefern. Rufino Cortez nimmt in Venezuela armen Dorfbewohnern mit Hilfe korrupter Behörden das Land, Harlan wurde von einer jungen Frau um Helfe gebeten, deren Vater wegen Cortez unschuldig im Gefängnis sitzt. Nachdem ein erster Versuch Cortez zu entführen auf Grund der schlechten Planung von Harlan fehlschlägt, übernimmt Michael das Ruder. Sams alter Freund Barry verschafft Michael die Tarnidentität eines Anwalts, der Cortez im Namen einiger Leute Land abkaufen will. So wollen Michael, Fiona, Sam und Harlan den Gängsterboss Cortez aus einer fahrenden Festung entführen.
Michael is bailed out of jail by an old friend who asks for his help in return.
Michael on helisemässä torjuttuaan käräyttäjien yhteistyötarjouksen. Linna kutsuu, mutta sieltä hänet pelastaa yllättäen vanha tuttu, joka puolestaan kaipaa apua venezuelalaiselle tyttöystävälleen. Kierot tonttivarkaat kun ovat ajaneet naisen perheen mailtaan ja passittaneet tämän isän väärin perustein vankilaan - mutta rajoittuuko avuntarve sittenkään siihen?
Suite à son refus de travailler pour l'homme dirigeant l'organisation responsable de sa Burn Notice, Michael se retrouve malencontreusement en prison et voit son statut de « fantôme » révoqué. Il devient de fait accessible à ses nombreux ennemis. Harlan, une vieille connaissance, paie sa caution et lui demande de l'épauler sur une affaire qu'il a à résoudre. Le père de sa cliente subit au Venezuela un chantage à l'expropriation mené depuis Miami. Michael, aidé de Sam, Fiona et Harlan, devra trouver le moyen d'aider sa cliente tout en déjouant les pièges des personnes qui en veulent désormais à sa vie.
DoLa cauzione di Michael viene pagata da un vecchio amico che chiede il suo aiuto in cambio del favore.
Michael se enfrenta a su detención cuando el equipo de Caral está a punto de capturarlo.
