真実(戸田恵梨香)が対策室に復帰。絵里子(天海祐希)の指示で、2年前に黒原(西田敏行)が狙撃された事件の捜査を一人でしていた真実は、狙撃事件の犯人と目されるテロリストグループ“黒い月”の幹部が、次々と殺されていることに気付く。そんな中、2体の爆死体が見つかり、“黒い月”との関連性が強いと推測した対策室のメンバーは捜査に乗り出す。