かつて大いなる危機より地球を守り抜いたヒーローがいた……。そして今、再びの危機に眉難高校『地球防衛部』より新たなヒーロー爆誕！ ……え？ かつてのヒーローって誰だって？ そりゃ『あいつら』ですよ『あいつら』。……え？ なんで名前をぼかすのかって？ そこはマルチなバースな設定なんでゴニョゴニョ……（うやむや） とにかく新たな防衛部――雲仙新九郎、酸ヶ湯愛琉志、卯花惣輔、長万部潮、阿蘇空太をよろしく！
謎の未来猫ヌルさんの猫科学で、『ハイカラ浪漫団』となり地球征服を目論む怪人をみごとに撃破した防衛部の５人。そんな彼らの前に現れたのは、謎のプレーリードッグことマスター・キャンに導かれし地球征服部、『蛮華羅新鋭隊』。その正体はなんと、黒玉寮の同居人にして眉難高校生徒会――百目鬼珠闘麗斗、乳頭左門、猫魔祐の三人であった。敵と味方が一つ屋根の下、これで何も起きないはずがなく……？（特に起きない）
月に一度の恒例行事、眉難高校美男子コンテスト。入学以来連続優勝記録を伸ばし続けている酸ヶ湯愛琉志は、まさに自他共に認める美しさのカリスマ。そして美しさにこだわる酸ヶ湯は、メディア戦略の先駆けとも言える画期的な作戦で連覇を狙っていた。だが、大正生まれの酸ヶ湯は知らなかった。その手法が光だけでなく闇の一面も持つことを……。今、眉難高校が燃え上がる！
御殿場寮長倒れる！ 親元を離れて暮らす寮生たちにとって、大黒柱たる寮長の不在はまさに生活の危機。だが、そんな時にこそ立ち上がるのが卯花惣輔という男。その家事スキルはまたたくまに寮生たちに安堵をもたらすも、卯花の母性が暴走し、防衛部を目の敵にする生徒會たちですらまとめて飲み込んでしまう。少年たちは浸食してくる母性に抗い親離れするのか？ 流されるがママ受け入れるのか？ 母だけに！
眉難市に夏到来！ 男乱海岸で眉難高校伝統の遠泳大会が開かれることになり、防衛部や生徒たちも活気づく。その中で、もっともこのイベントに打ち込んでいるのは生徒会長の百目鬼珠闘麗斗。地球征服もひとまず忘れ遠泳大会優勝に賭けるその情熱には、何やら雲仙新九郎との過去からつながる因縁があるようで……。そして激突する百目鬼と雲仙。勝利の鍵を握るのは……赤フン？
眉難高校は夏休みに突入し、阿蘇空太は山の幸で釣った食いしん坊の長万部を連れて里帰り。故郷の村で二人を待っていたのは、阿蘇の三人の弟たち。防衛部では末っ子扱いの阿蘇も故郷では立派なお兄ちゃんっぷりを見せつけるが、次男のとん太だけはなぜか阿蘇に反発。兄弟ゲンカで飛び出したところを、たまたま近くに避暑に来ていた征服部に怪人にされてしまう！ 兄弟の絆の行く末は？ そして雲仙たちの出番は？
長万部潮は思い悩んでいた。今時大食いというのはありふれた特徴でしかなく無個性なのではないか、と。そして悩んでいた長万部はヌルさんと共に海の中へと消え……蟹工船に乗ることになった！ 休む間もなく蟹を穫り、蟹を加工する過酷な労働の日々の中、長万部の空腹はついに限界に達して……！ 同じ頃、防衛部と征服部もまた動き出し、やがて蟹工船に全ての役者が揃い……そして舞台の幕はあがる！
公爵家の嫡男として規律正しく生きてきた百目鬼だが、幼い頃、そんな価値観に風穴を開けるような運命の出会いがあった。それは今も百目鬼の心に強く残っていて…。一方、ハイカラハイカラ言い続けてきた自身のハイカラ観のふわふわ加減に８話にしてついに気づく雲仙。そんな雲仙に訪れたのは、転校生――小石川楽愛との出会いだった。接近する二人に、百目鬼の心は揺れて…。「ハイカラってことさ」「俺はハイカラでいいんだ！」
眉難高校に衝撃走る！ 入学以来、美男子コンテストを連覇してきた酸ヶ湯が小石川に敗れ王座から陥落したのだ！ そればかりか黒玉寮への入寮や、地球防衛部への入部もほのめかしたりして、少しずつ小石川の影響が防衛部内に広がっていく。百目鬼はそんな小石川の行動を危ぶみ、敵視しているはずの雲仙に警告する――が、時既に遅く、小石川の魔性の魅力は防衛部を虜にしてしまうのだった。防衛部に最大の危機到来か？
幼き日より百目鬼に忠誠を誓う乳頭左門と猫魔祐。しかし猫魔には実家が華族とは名ばかりの貧乏男爵家というコンプレックスがあり、上昇志向をこじらせていた。その心の隙間に小石川が忍び寄る。防衛部だけでなく、生徒會にもちょっかいをかける小石川の真意とは？ そして、小石川の甘言に乗せられついに下剋上に乗り出す猫魔の前に立ちはだかるのは、彼が脳筋と侮っていた乳頭。今、征服部の絆が試される！
雲仙のやらかしによりハイカラ浪漫団の正体が防衛部であることを知ってしまった百目鬼は、破滅の未来を回避するためとはいえ、雲仙と正面から戦うことを決意できずに思い悩む。雲仙は防衛部のみんなとクリスマスパーティーの準備でてんやわんやで、その陰では小石川が何かを待っているかのような様子を見せる。そして迎えたクリスマス、ついに百目鬼と雲仙の確執が明らかになる。あと、ついでに全ての黒幕も明らかになる。
傷つき倒れるハイカラ浪漫団と蛮華羅新鋭隊の前に現れたのは全ての黒幕――鶏貴族デューク・フリードリ！ 未来鶏のフリードリは歴史を変えるという目的のため、防衛部と征服部を争わせていたのである。絶体絶命のピンチの中、手を取り合ってフリードリに挑む防衛部と征服部。しかし、そこに雲仙と百目鬼の姿はない。果たして二人はかつての絆を取り戻せるのか？ そして、未来は守られるのか？ 頑張れ、ハイカラ浪漫団！ 負けるな、蛮華羅新鋭隊！ マルチなバースの向こうから『あいつら』も応援しているぞ！
