Önder Özcan illegal dergi dağıtımı gerekçesiyle gözaltına alınmış, götürüldüğü karakolda bir süre sonra ölmüştür. Önder'in ölüm sebebi polis kayıtlarına intihar olarak geçmiştir. Öte yandan Önder'in intihar ettiğine inanmayan yakınlarının suç duyurusunda bulunması üzerine, konuyla ilgili adli ve idari soruşturma açılmıştır. Mülkiye Müfettişi konuyu aydınlatması için Behzat Ç.'yi görevlendirir. Behzat Ç. bu görevin kendisine verilmesinin altında başka hesaplar yattığını anlar. Soruşturmanın ilerlemesiyle Önder'in ölmeden kısa bir süre önce ölüm tehditleri aldığı ortaya çıkar. Ailesi, Önder'in gözaltına alınmadığını, kimliği belirsiz birtakım kişiler tarafından kaçırılıp işkenceyle öldürüldüğünü iddia etmektedir. Behzat Ç.'nin olayı çözmek için attığı her adım emniyet içindeki dengeleri bozmaya başlayacaktır. Bu durum emniyetin bazı birimleriyle cinayet büroyu karşı karşıya getirecektir.
Yasadışı dergi dağıtımıyla suçlanan bir adam gözaltında ölünce, Behzat kendini meslektaşlarını etkileyebilecek hassas bir soruşturmanın içinde bulur.