Protagonist Gunzo Chihaya and his friends, with the help of renegade Fog A.Is, head towards the United States to present blueprints for a weapon that will turn the tides of war in humanity's favor. It is easier said than done because Gunzo and the rest of Arpeggio's crew have gotten the attention of the mysterious Admiralty Code.
Now they must face a new Fleet of Fog threat known as "Fog Student Council," who are mental models dressed like high school girls. The Fog Student Council preaches that Earth's morals must correspond to the Fog's morals.
世界に対し降伏勧告を行った千早群像の父・翔像。
イ401の艦長・群像は、父と再会し
霧による海洋封鎖の理由を問い質すべく、北極海へ向かう。
L'histoire de ce film est inédite. Elle met en scène de nouveaux personnages parmi lesquels les membres du Conseil Étudiant du Brouillard : Nachi, Haguro, Ashigara, la vice-présidente Myôkô et la présidente Hiei.
Ces dernières ayant pour mission de maintenir la cohésion et l'éthique de la Flotte du Brouillard car, "l'éthique de la Flotte, c'est l'éthique de la Terre".
Deux nouveaux navires sont également présents : le Musashi et le Yamato, en références aux puissants vaisseaux de la marine impériale japonaise coulés durant la Seconde Guerre mondiale.
Le père de Gunzô Chihaya, Shôzô Chihaya, apparaît également dans le film.