昭吾(佐藤勝利)が朝目覚めると、シグマ(髙石あかり)が朝食を準備し、順子(河井青葉)とクロスワードパズルで盛り上がっていた。初めて見た母親の笑顔に戸惑いながらも温かな気持ちが芽生え、少しずつシグマと惹かれあっていく昭吾だが、マスコミに追われるシグマにとっては、平穏な時間に限りがあった。 マネージャーの榎(池内博之)に連れ戻され、ジェットヤマベ(ふかわりょう)と対峙したシグマは、失われた自分らしさを模索しながら「アポロの歌」という新曲を提案するが…!? 一方、限られた時間の中でシグマと落ち合った昭吾は、これまで抱えてきた罪を初めて打ち明ける―― 世界をさすらい繰り返す“パラレル・ラブストーリー”、第二世界「歌手シグマ」編、完結。
下田(西垣匠)に助けられた昭吾(佐藤勝利)は、母・順子(河井青葉)の奇妙な拒絶に戸惑いながら、基地へ案内されることに。そこでは、ひろみとそっくりな女性の肖像画が飾られ、「シグマ王」と呼ばれていた――! 元々人間が作り出した合成人が、逆に人間を支配していること、そして合成人の頂点に君臨し人間を虐殺する命令を出しているのが「シグマ王」であるという説明を受けた昭吾は、暗殺部隊=レジスタンスとしての使命を言い渡される。それは、「シグマ王を暗殺し、人間の尊厳を守ること」だった――。 理解する間も無く、シグマ王暗殺のため康子(森田想)と宮殿に忍び込むことになった昭吾は、ひろみとそっくりなシグマ王と対峙することとなり…!? 世界をさすらい繰り返す“パラレル・ラブストーリー”、第三世界「シグマ王」編、開幕!