As an alien force hurtles toward NHK headquarters in Tokyo, the NHK building springs to life as an evangelion-transformer to battle the foe.
Un Ovni a été détecté par les satellites japonais qui va s'écraser sur Terre et son point de chute est Tokyo, sur le batiment de la NHK. À cette nouvelle, le Projet Omega est enclenché et le bâtiment NHK se transforme en mecha géant qui va tenter d'arrêter l'ovni titanesque. Mais la partie s'annonce difficile!
Enquanto uma força alienígena se dirige ao quartel-general da NHK em Tóquio, o edifício da NHK ganha vida como um transformador de Evangelho para combater o inimigo.