İstanbul’da halk arasında İstanbul emniyetinin başarısızlığına dair oluşan kanaat; emniyet mensuplarını, suçun kalbine inecek genç bir ekip kurmaya iter. Bunun için emniyetin efsane amirlerinden Fırtına Cemal görevlendirilir. Cemal, kural tanımaz ama yetenekli genç polisleri ekibine toplar. Cemal ve ekibi masum halkın koruyucu melekleri olmaya, güzeller güzeli İstanbul’a sahip çıkmaya canları pahasına yemin etmişlerdir. “Şehrin Melekleri” suça karşı adalet, şiddete karşı şefkat, ihanete karşı bağlılıkla mücadele eden büyük bir efsaneye dönüşeceklerdir. İstanbul’un masumiyetini çalanlar, şehri kan ve korkuya boğanlar için artık hiçbir şey eskisi kadar kolay olmayacaktır.
Son günlerde İstanbul’da peş peşe kaçırılan çocukların faili ve kaçırılma nedenleri bulunamamaktadır. Kaçırılan çocukların arasında ünlü işadamı Ceyhun Selimoğlu’nun 6 yaşındaki oğlu da vardır. Davayı devralan Fırtına Ekibi hiç vakit kaybetmeden çalışmalara başlar. Fakat bu vakada hiçbir şey göründüğü gibi değildir ve ekibimiz şüpheli sayısı arttıkça, herkesin sakladığı sırları olduğunu ve hiç kimsenin aslında göründüğü gibi olmadığını fark edecektir. Düğüm çözüldükçe ortaya çıkan sırlardan özellikle bir tanesi, ekipteki herkes için büyük bir şoka sebep olacaktır...
İdil’in babası Adil müdürün hedef alındığı ve annesinin de ölümüne neden olan suikastın aydınlanması için tek kilit isim olan Ceyhun Selimoğlu’nun şüpheli ölümü emniyeti ikiye bölmüşken, İstanbul’da sahile vuran kimliği belirsiz kadın cesetleri Fırtına Timi için çözülmesi gereken yeni bir vaka olur. Cesur polislerimiz bu toplu cinayetin sır perdesini aralamakla meşgulken, emniyet içindeki köstebek, suikast ile ilgili delilleri çarpıtarak, ekibimizin bir adım önünde kalmak için çalışmaktadır.
Fırtına Cemal ve ekibinin en önemli görevi Adil Amir’in dosyasını çözmektir. Şehrin Melekleri 4. Bölümde Adil Gündoğan’ı vurma emrini Ceyhun Sinanoğlu verdiği öğrenilir. Fırtına Cemal ve ekibi her hafta Adil Amir’in dosyasını daha derine incelemeye devam edecekler. Fırat’ın ise başı kendisiyle dertte. Bu sefer Fırat haksız olduğunu da farkında tek çıkar yol istifa etmek.
Bedirhan Kuloğu'nun köstebeği Gürkan ve haksızlığa dayanamayan Fırat arasında gerilim yaşanıyor. Cemal ve ekibinin işi bu defa daha zor.