Sydney wird verfolgt: von wirren Albträumen und Agenten aus den eigenen Reihen. Die Spur ihrer Träume führt sie in eine Wohnung in Rom, in der sie untertauchen kann. Trotz Jacks Bemühungen, seine Tochter zu schützen, ahnt Lauren längst, dass Sydney in den Mord an Lazarey verwickelt ist. Nun kann sie ihren Verdacht bestätigen und informiert Lindsey vom Sicherheitsrat. Gerade als Sydney den Ursprung ihrer Albträume auflösen kann, wird sie von Agenten verhaftet.
Jack takes drastic measures to ensure that the NSC never finds out the truth about Sydney's murder of a Russian diplomat. But his actions place a heavy strain on Vaughn's marriage, as Lauren gets closer and closer to the truth about Sydney. Meanwhile, Sydney agrees to go on a mission with Sloane in order to thwart plans to obtain the operating system to a deadly weapon -- and she discovers an unlikely ally in the hunt for her missing two years.
Sydney réussit à intercepter l'appareil convoité par la Convention et lors de la confrontation finale, elle abat Allison. Mais de son transfert vers l'hôpital, cette dernière parvient à s'échapper en dépit de ses blessures ... Un peu plus tard, Sydney rencontre le psychologue de la CIA afin de lui faire part de son désir d'entamer une procédure expérimentale permettant de luirendre la mémoire. Mais celui-ci tente de l'en dissuader ... Pour sa prochaine mission, Sydney doit accompagner Sloane afin de voler une arme laser destructrice dont veut s'approprier la Convention ...
Sydney kénytelen elvállalni egy közös akciót Sloane-nal. Bár nem bízik benne, tudja, hogy a férfi is vásárra viszi a bőrét. Sanchezt elfogják Mexikóban. Hogy ne adják ki Kubának, ahol halálbüntetés várna rá, felajánlja, hogy információt szolgáltat egy CIA-s bérgyilkosról. Jack nem tudja megakadályozni, hogy Lauren Mexikóba utazzon. Útonállókat bérel fel, hogy feltartóztassák, ő közben végez Sanchezzel. Sark azonban elárulja Laurennek, hogy Sydney ölte meg az apját, Lazarejt, ő az a bizonyos Julia Thorne. Vaughn segít Sydneynek kijutni az országból.
Jack prende drastiche misure affinché il CSN non scopra il coinvolgimento di Syd nella morte del diplomatico russo. Ma la sua azione provoca scompiglio nel matrimonio fra Vaughn e Lauren, la quale è ad un passo dalla verità. Sydney va in missione con Sloane allo scopo di ottenere il sistema operativo di un'arma mortale.
Jack toma drásticas atitudes para garantir que a NSC nunca descubra a verdade sobre Sydney ter matado um diplomata russo. Mas suas ações acabam causando uma grande tensão no casamento de Vaughn, quando Lauren fica cada vez mais próxima de descobrir a verdade sobre Sydney. Enquanto isso, Sydney concorda em participar de uma missão com Sloane para obter o sistema operacional de uma mortal arma — e ela descobre um inesperado aliado em sua busca pela verdade do seu paradeiro de dois anos.
Sydney (Jennifer Garner) y Sloan (Ron Rifkin) se ven obligados a realizar una misión juntos: deben volar hasta China y recuperar un objeto importante. A la vuelta del viaje Sloan le entrega a Sydney un sobre cerrado con un código y una llave. La letra es indudablemente la de Sydney.
Sydney musí zneškodnit přístroj, který by v rukách Dohody mohl zabíjet lidi. Vše se však zvrtne. Sydney je zatčena a hrozí jí deportace na Sibiř.
Sydney ontwaakt uit een nachtmerrie waarin ze een engelachtige figuur ziet, en trekt vreemde buisjes uit haar mysterieuze litteken. Jack neemt drastische maatregelen om ervoor te zorgen dat de NSC nooit achter de waarheid komt over de door Sydney gepleegde moord op een Russische diplomaat. Ondertussen stemt Sydney in met een missie met Sloane om te voorkomen dat een besturingssysteem van een dodelijk wapen in verkeerde handen valt. Daarbij ontdekt ze een onwaarschijnlijke bondgenoot in de jacht op haar 'verloren' twee jaar.