『才人工房（クローンドリー）』で能力開発を受けていた幼き日の警策は、同じ施設で治療を受けていたドリーの世話を任されていた。ある日、ドリーの生命維持装置に疑念を抱いた警策は、彼女の「治療」の真実を知ってしまう。クローンとして生み出されたドリーは、実験のために命を削られていたのだ。実験を中止してほしいという訴えもむなしく、捕らえられドリーと引き離されてしまう警策。学園都市に抱いた深い怒りと憎しみを糧に、復讐を誓って戦い、敗北し続けた彼女がたどり着いた計画は、またも失敗に終わる。その先に待っていたのは、ドリーを巡るもう一人の少女「みさきちゃん」との出会いだった――。
A young Kozaku grins and bears her way through her youth in an Academy City research institution, where she befriends Dolly, one of the other girls there. But when Kozaku learns the grim truth about Dolly, it sets her on a life-altering course.
Von Kuroko besiegt liegt Mitori in der Kanalisation und denkt an ihre Zeit mit Dolly zurück, als Misaki auf einmal neben ihr auftaucht. So treffen die beiden, die Dolly am besten kannten, zum ersten Mal aufeinander. Andernorts feiern die Judgment-Mädchen und Misaka Kurokos vollständige Genesung.
Dolly é um elo entre Mitori e Misaki que mudou o destino das duas garotas, direcionando o objetivo de suas vidas, que é lutar contra um inimigo muito poderoso.
Agonisante, Mitori Kôzaku se remémore cette douce époque avec le clone Dolly et ce qui a conduit à leur séparation. Misaki Shokuhô, qui avait donc côtoyé le clone après le départ de Mitori, approche donc la jeune femme avec une idée claire en tête.
'재인공방'에서 능력 개발 실험을 받던 어린 시절의 코자쿠는 같은 시설에서 치료를 받고 있던 톨리를 돌보는 역할을 맡게 된다. 어느 날, 돌리의 생명 유지 장치에 대해 의문을 품게 된 코자쿠는 그녀가 받고 있는 '치료'의 정체를 알게 된다. 클론으로 태어난 돌리는 실험 때문에 수명이 점점 깎여나가고 있었다. 실험을 중지해 달라고 호소해 보지만 붙잡혀 돌리와 떨어지게 된 코자쿠. 학원도시에 대한 깊은 분노와 슬픔을 느끼면서 복수를 맹세하고 싸우면서 계속 패배한 그녀가 다시 참여한 계획은 또 실패로 끝이 났다. 그리고 그녀를 기다리고 있는 것은 돌리를 알고 있는 또 한 명의 소녀 '미사키'와의 만남이었다.
Kozaku ripensa a quando da bambina era tenuta in un istituto di ricerca della Città Studio, e della sua amicizia con Dolly. Ma la scoperta della triste verità su Dolly le cambia totalmente la vita.
尽管另一个多莉共享了多莉与看取和食蜂相处时的情感经历和记忆，她终究不是多莉，真正的多莉死了，这就是事实。另一个多莉的安排，只是对活着的食蜂与看取的一个救赎。小时候的警策得知“统括理事会（指着无窗大楼）是一切悲剧的根源”，后来她先是参与了对统括理事会的袭击，然后被投入少年感化院，木原幻生根据警策心中熊熊燃烧的复仇之火选中了她，准备以恶心亚雷斯塔作为复仇的成果。
食蜂通过读取幻生记忆得知的“多莉（0号）的妹妹”并不是御坂00000号。而这个妹妹是继承了多莉记忆的个体，不是多莉本人。多莉、警策和食蜂幼年时所处的研究机关——才人工房后来在第三研究室“内部进化”发生了AIM扩散立场聚合体暴走事件，结果被木原脑干警告，食蜂也暗中叫停了对才人工房的经济支援，最终才人工房被食蜂掌握在手中。
如果食蜂操祈放任黑子初春佐天三人参与到本次事件，那么毫无疑问她们将团灭。食蜂操祈的手段是否正确姑且不论，但确实造成了好的结果。警策拿到的U盘里不仅有多莉实验的真相，还有“素养判定”等机密，素养判定是可以颠覆学都能力等级秩序的存在
Mitori recuerda su tiempo en una instalación donde terminó siendo amiga de Dolly antes de conocer a Misaki. Después de descubrir que Dolly era un clon que estaba siendo alimentado con drogas experimentales, fue atrapada y confinada durante varios meses, lo que generó un odio creciente hacia la junta de gobierno.
