タケルたちの活躍によって滅んだはずの恐怪帝国が復活した。ヤジューロウたち三幹部は、ちょっと間抜けな新幹部を仲間に加え、皇帝・ディスカードの復活を企む。一方、その動きに気づいたタケル、マリ、カイトは、野望を阻止するため、再び鳳神ヤツルギ、天神キサラ、哮神ガイオンになり立ち向かう。そんななか、恐怪帝国とは別の敵の影が。今、木更津の地で熱い戦いが始まる！
