キサラに覚醒したマリだったが、力が足りず体に大きな負担がかかり、一時的に戦えなくなってしまう。マリはマコトと相談し、これからも戦いを続けることを決意し、神社で修業を始めることとなった。 そんな時、カイトが一人の少女を連れて八釼神社へやってくる。彼女の名は穂積ヒメ。恐怪帝国にさらわれた科学者・穂積博士の一人娘。これから神社で預かることとなるのだった。 恐怪帝国は新たな恐怪獣・イカフィアーを誕生させ、再び地上の人間たちの心を惑わせ始めた。タケルが駆けつけ戦う中、自信に満ち溢れたカイトが現れる。ブレスレットをかざし、カイトは叫ぶ。「ガイオン・ミッションスタート！」