物語は、ガンタという名前の男の子とイサキという名前の女の子の2人の不眠症の学友に焦点を当てています。 どちらも常に睡眠不足を心配しています。 学校の展望台から保管室に変わった部屋で偶然会った後、2人は秘密を共有し、異常なつながりを持ち始めます。
石川県七尾市。不眠症に悩む高校1年生の中見丸太（なかみ・がんた）は、校内の使用されていない天文台でクラスメイトの曲伊咲（まがり・いさき）と遭遇し、彼女も自分と同じ悩みを抱えていることを知る。これまでほとんど話したことのない2人だったが、不眠症という秘密を共有することで絆が芽生えはじめる。そんなある日、2人が仮眠場所として天文台を勝手に使っていたことがバレてしまい、天文台は立ち入り禁止になってしまう。伊咲の寂しそうな表情を見た丸太は、休部となっていた天文部を復活させることを決意する。